Problème résolu, pour ceux qui ont le même soucis que moi, il suffit de mettre en haut du thème sous les balise méta ceci:
<!-- code stats --> <body><script type="text/Javascript"> istat = new Image(1,1); istat.src = "http://www.sonic-webradio.net/statistiques/counter.php?sw="+screen.width+"&sc="+screen.colorDepth+"&page="+location.href+"&ismodule=news"; </script></body> <!-- fin du code -->
Et ça fonctionne impécable, donc avec une version 2.5 de Xoops il ne faut pas mettre le code à la fin mais au début ou tout du moins dans une balise body propre à lui.